Сдам Сам

ПОЛЕЗНОЕ


КАТЕГОРИИ







Особенности распределения трехлокусных гаплотипов в исследованных популяциях.





В выборках русских, украинцев и белорусов были определены частоты трехлокусных гаплотипов(DRB1 - DQA1 - DQB1)

Распределение частот трехлокусных гаплотипов в исследованных популяциях показано в табл. 4.

Сравнительный анализ представленных данных выявляет наличие общих и индивидуальных особенностей распределения гаплотипов в каждой популяции.

Среди белорусских популяций определяется высокая частота гаплотипов: DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301 и DRB1*15-DQA1*0102-DQB1*0602-8, а также DRB1*01-DQA1*0101-DQB1*0501.

В украинских популяциях отмечается высокие частоты гаплотипов DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301 и DRB1*01-DQA1*0101-DQB1*0501, а также гаплотипа DRB1*07-DQA1*0201-DQB1*0201, а среди западных украинцев (Львовская область) выявлена высокая частота гаплотипа DRB1*04-DQA1*0301-DQB1*0302.

В русской популяции обнаружены высокие частоты гаплотипов: DRB1*01-DQA1*0101-DQB1*0501, DRB1*15-DQA1*0102-DQB1*0602-8, а также DRB1*04-DQA1*0301-DQB1*0302 и DRB1*07-DQA1*0201-DQB1*0201.

В среднем наблюдается однотипность частотного распределения трехлокусных гаплотипов DRB1-DQA1-DQB1 у всех представленных популяций. Отличительной особенностью является отсутствие или низкие частоты гаплотипов: DRB1*09-DQA1*0301-DQB1*0303 и DRB1*12-DQA1*0501-DQB1*0301, которые более характерны для монголоидной популяции.

Несмотря на определенную схожесть частотного распределения, в отдельных популяциях отмечается наличие гаплотипов, которые отсутствуют у других, например: в северной белорусской популяции (Витебская область) - DRB1*12-DQA1*0601-DQB1*0301, в полесской популяции (Брестская область) - DRB1*01-DQA1*0102-DQB1*0502/4, DRB1*03-DQA1*0501-DQB1*0301, в восточной украинской популяции (Хмельницкая область) - DRB1*11-DQA1*0103-DQB1*0602-8, DRB1*15-DQA1*0102-DQB1*0502/4, у западных украинцев (Львовская область) - DRB1*09-DQA1*0301-DQB1*0201, DRB1*14-DQA1*0101-DQB1*0501 и DRB1*14-DQA1*0101-DQB1*0502/4, в северной русской популяции (Вологодская область) - DRB1*04-DQA1*0301-DQB1*0305.



 

 

Таблица 4.Распределение трехлокусных гаплотипов в исследованных популяциях.

Гаплотипы DRB1-DQA1-DQB1 Белорусы север. (Вит. обл.) N=100 (%) Белорусы южн. (Брест. обл.) N=105 (%) Украинцы вост. (Хмел. обл.) N=137 (%) Украинцы запад. (Львов. обл.) N=102 (%) Русские (Волог.обл.) N=121 (%)
*01-0101-0501 10,0 10,0 9,5 12,2 12,4
*01-0102-0502/4 0,0 0,5 0,0 0,0 0,0
*03-0501-0201 7,0 8,7 5,5 7,8 7,0
*03-0501-0301 0,0 0,5 0,0 0,0 0,0
*04-0301-0201 0,0 0,5 0,4 0,0 0,0
*04-0301-0301 1,5 1,9 2,9 1,0 1,6
*04-0301-0302 5,5 9,5 7,3 10,3 11,6
*04-0301-0304 0,5 0,5 0,0 0,0 0,0
*04-0301-0305 0,0 0,0 0,0 0,0 0,8
*04-0301-0401/2 0,0 0,5 0,4 0,0 0,0
*07-0201-0201 7,5 7,6 12,4 11,3 10,7
*07-0201-0303 3,0 2,9 2,2 3,9 4,1
*08-0101-0401/2 0,0 0,0 0,4 0,0 0,0
*08-0301-0302 0,0 0,0 0,7 2,4 0,0
*08-0401-0401/2 4,0 2,9 2,5 2,0 5,0
*08-0601-0301 1,5 0,0 0,0 0,0 0,4
*09-0301-0201 0,0 0,0 0,0 0,5 0,0
*09-0301-0303 0,0 1,9 0,4 1,0 2,5
*10-0101-0501 0,0 0,5 1,1 0,0 0,4
*11-0103-0602-8 0,0 0,0 0,4 0,0 0,0
*11-0501-0301 15,0 13,3 18,2 18,6 9,1
*11-0501-0303 0,0 0,0 0,0 0,0 0,4
*12-0501-0301 3,5 3,8 2,2 0,5 1,2
*12-0601-0301 0,5 0,0 0,0 0,0 0,0
*13-0102-0602-8 7,0 0,9 2,2 2,4 2,5
*13-0103-0602-8 8,0 7,6 7,3 4,9 8,7
*13-0301-0301 0,0 0,0 0,0 0,0 0,4
*13-0501-0301 1,0 3,3 2,9 3,4 3,3
*14-0101-0501 0,0 0,0 0,0 0,5 0,0
*14-0101-0502/4 0,0 0,0 0,0 0,5 0,0
*14-0101-0503 1,0 2,9 2,2 1,0 1,2
*15-0102-0502/4 0,5 0,0 0,4 0,0 0,0
*15-0102-0602-8 16,5 11,4 8,8 9,3 14,0
*15-0103-0601 1,5 1,9 0,7 0,5 0,4
*16-0102-0502/4 5,0 6,7 8,8 5,9 1,6

 

 

Сравнение частоты трехлокусных гаплотипов в исследованных популяциях.

При попарном сравнении (0,05 и 0,01 уровни значимости) распределения трехлокусных гаплотипов (DRB1-DQA1-DQB1) между исследованными восточнославянскими популяциями было установлено, что достоверно различаются восточные украинцы из Хмельницкой области и русские из Вологодской области частотным содержанием следующих гаплотипов: DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301 и DRB1*16-DQA1*0102-DQB1*0502/4.

Изучение распределения гаплотипических сочетаний показало, что наиболее информативным был сравнительный анализ трехлокусных гаплотипов. Исходя из этого, было бы целесообразным провести сравнение распределения трехлокусных гаплотипических сочетаний в исследованных популяциях с аналогичными данными из литературных источников. Однако данные по трехлокусным гаплотипам в доступной нам литературе практически не были представлены, поэтому в анализ были включены сведения о HLA–профиле некоторых популяций по локусу DRB1 как наиболее полиморфному из исследованных [Terasaki P.I., Gjertson D.W., 1997].

Результаты многомерного кластерного анализа изученных популяций в сравнении с некоторыми народами Европы выявили следующие особенности. Все популяции, представленные на дендрограмме (рис.2), образовали три кластера: «североевропейский», «центрально-европейский» и «южно-европейский». Русские из Вологодской области вошли в «североевропейский» кластер, наряду с немцами, датчанами, голландцами, финнами, ирландцами и англичанами. «Центрально-европейский» кластер включил в себя белорусов, чехов, бельгийцев, австрийцев, швейцарцев, французов, хорватов, украинцев, словаков и венгров. Внутри этого кластера в зависимости от генетической близости популяции распределяются следующим образом: белорусы (Витебская и Брестская области) составляют одну группу с чехами, бельгийцами, австрийцами и швейцарцами, украинцы (Хмельницкая и Львовская области) - со словаками и венграми. В «южно-европейский» кластер вошли болгары, греки и итальянцы.

Те же данные представлены в виде двухмерного графика многомерного шкалирования. (рис.3) Центральное место на графике занимают популяции, составляющие «центрально-европейский» кластер. Северные белорусы (Витебская область) несколько отдалены от основного «ядра» популяций, что, вероятно, обусловлено своеобразием указанной популяционной группы (возможным влиянием балтских племен) или недостаточным размером выборки, взятой для анализа.

С одной стороны к «центрально-европейскому» кластеру примыкают «североевропейские» популяции, из которых ближе всех к центру расположены русские из Вологодской области. Положение русских на графике свидетельствует о сочетании в генофонде указанной группы «североевропейских» и «среднеевропейских» генов. С другой стороны от «ядра» основных популяций расположились «южно-европейские» популяции: болгары, греки и итальянцы.

Подобную картину можно объяснить особенностями расселения и освоения земель древними славянами и историей формирования изученных популяционных групп.

 

 

Рис.2 Дендрограмма генетических расстояний на основании частот аллелей DRB1 локуса у представителей восточнославянских популяций и некоторых народов Европы

 

 

 

Рис 3. График многомерного шкалирования генетических расстояний на основе частот гена DRB1 у представителей восточнославянских популяций и некоторых народов Европы.

Бел. сев. – белорусы северные (Витебская область), Бел. южн. – белорусы Полесья (Брестская область), Укр. вост. – украинцы восточные (Хмельницкая область), Укр. зап. – украинцы западные (Львовская область), Рус. – русские (Вологодская область), Болг. - болгары, Хорв. – хорваты, Слов. – словаки, Венг. - венгры, Бельг. – бельгийцы, Австр. – австрийцы, Нем. – немцы, Франц. – французы, Датч. – датчане, Гол. – голландцы, Фин. – финны, Швейц. – швейцарцы, Ирлан. – ирландцы, Англ. – англичане, Итал. - итальянцы

 

Представленный в этой работе анализ полиморфизма аллелей генов HLA можно рассматривать как часть популяционных исследований, проводимых среди восточнославянских этносов: антропологические исследования, анализ митохондриальных и Y-хромосомных, а также других аутосомных маркеров ДНК. Наиболее полная информация по восточнославянским народам была получена в ходе нескольких антропологических экспедиций: «Русской антропологической экспедиции» (В.В. Бунак, 1965), «Украинской и Прибалтийской антропологических экспедиций» (Дьяченко, 1965, Витов, Чебоксаров, 1959). Для исследований были использованы следующие методы: оценка антропологических признаков (размеры головы и лица, показатели цвета волос и глаз, интенсивности роста бороды, форма носа), дерматоглифика, география фамилий и т.п. Ареал славянских народов находится в рамках той обширной зоны, которая разделяет ареалы северных и южных европеоидов, выделяющихся, в пределах европеоидной расы, максимально светлой и максимально темной пигментацией. Население этой переходной зоны отличается большим разнообразием локальных сочетаний антропологических признаков.

Принято объединять эти локальные варианты в две группы – западноевропейскую и центрально-восточноевропейскую. На территории Восточной Европы распространены, в основном, четыре расы: среднеевропейская, альпо-карпатская, индо-средиземноморская и лапоноидная. Каждая из них, за исключением лапоноидной, представителями которой являются саамы, представлена рядом антропологических типов. На крайнем востоке Европы у многих из этих типов проявляется древняя уралоидная примесь, которая может сочетаться с понтийским компонентом (характерным для южных европеоидов), а также - с относительно недавним влиянием южно-сибирской монголоидности.

На северо-западе Восточной Европы по побережью Балтики среднеевропейская раса включает атланто-балтийский компонент. В беломоро-балтийской зоне черты северных европеоидов сочетаются с определенным уралоидным компонентом. У восточнославянских народов наиболее заметно присутствуют черты среднеевропейской расы. На юго-западе расселения восточных славян присутствует заметное участие альпо-карпатского компонента. На юге и юго-востоке – понтийского, который может быть отмечен у болгар и албанцев, живущих на Украине; на востоке – субуральского, на севере – беломоро-балтийского [Алексеева Т.И., 1999].

В настоящее время широко используется относительно новый метод - геногеография, где для анализа используются генетически наследуемые мало полиморфные системы, в частности система ABO, некоторые биохимические маркеры. Информация о генофонде населения Восточной Европы содержит данные из литературных источников, опубликованных с 1985 по 1995 гг. Геногеография народонаселения способна напрямую связывать генетическую действительность современных поколений с древностью. В результате исследования было обнаружено, что из всех воздействий на генофонд за все время существования населения Восточной Европы главное формообразующее значение имели воздействия в направлении запад-восток. Они носили характер проникновения с запада – юго-запада и распространения по Восточной Европе генных комплексов европейского и балканского происхождения и их носителей – древних народов и племен. Население Восточной Европы постепенно и достаточно равномерно генетически становилось европейским, но эта генетическая «европеизация» не дошла до конца. Возникло некое равновесие между европейскими и азиатскими влияниями, возникло своего рода евразийское равновесное состояние генофонда народов Восточной Европы [Алексеева Т.И., 1999].

Несмотря на то, что типирование генов HLA – относительно новый подход, создающий новые возможности в оценке генетического профиля популяций, трудно сравнивать результаты, представленные в этой работе, с данными анализа других генетически наследуемых факторов, полученными в ходе многолетних исследований из-за разницы в количестве обследованных популяционных групп. Тем не менее, даже такое небольшое количество изученных популяций отражает основные закономерности геногеографического взаиморасположения исследованных восточнославянских групп. В результате этого можно заключить, что, несмотря на влияние естественного направленного отбора, система генов HLA сохраняет свое разнообразие, приуроченность различных вариантов её генов к определенным этническим группам и адекватно отражает геногеографию различных популяций, и, следовательно, может быть использована в популяционных исследованиях.

 

 

ВЫВОДЫ:

1. Самыми частыми аллельными вариантами DRB1 гена для всех изученных популяций являются: DRB1*07, *11, *13, *15, что соответствует западно-евразийскому типу распределения.

2. При попарном сравнении распределения специфичностей гена DRB1 между восточными украинцами и русскими выявлены достоверные различия в частотном содержании DRB1*11 и DRB1*16.

3. При попарном сравнении распределения аллелей гена DRB1 выявлено, что западные украинцы достоверно отличаются от русских частотным содержанием DRB1*11.

4. Сравнительный анализ представленных данных отмечает, что у всех популяций часто встречаемыми являются следующие трехлокусные гаплотипы: DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301, DRB1*15-DQA1*0102-DQB1*0602-8, DRB1*01-DQA1*0101-DQB1*0501, DRB1*04-DQA1*0301-DQB1*0302 и DRB1*07-DQA1*0201-DQB1*0201

5. Отличительной особенностью является отсутствие или низкие частоты гаплотипов: DRB1*09-DQA1*0301-DQB1*0303 и DRB1*12-DQA1*0501-DQB1*0301

6. При попарном сравнении частот распределения трехлокусных гаплотипов (DRB1-DQA1-DQB1) восточных украинцев с русскими было установлено, что достоверными являются различия в частотном содержании DRB1*11-DQA1*0501-DQB1*0301 и DRB1*16-DQA1*0102-DQB1*0502/4.

7. Результаты многомерного статистического анализа выявили, что изученные популяции образуют два кластера»: «южный», включающий украинцев (Хмельницкая и Львовская области), и «северный», включающий белорусов (Витебская и Брестская области) и русских из Вологодской области.

8. При проведении многомерного кластерного анализа изученных популяций и некоторых народов Европы выявлено, что белорусы из Витебской и Брестской областей и украинцы из Хмельницкой и Львовской областей генетически близки с «центрально-европейскими» популяциями. Русские из Вологодской области сходны по HLA–профилю с «североевропейскими» и «центрально-европейскими» популяциями.

9. На примере восточных славян показано, что, несмотря на влияние естественного направленного отбора, система генов HLA адекватно отражает геногеографию этих этнических групп, и может быть использована в популяционных исследованиях.

 

 

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

Данные о распределении специфичностей генов HLA II класса и их сочетаний у здоровых представителей белорусских, украинских и русской популяций могут быть использованы в качестве контрольных для поиска маркеров генетической предрасположенности к развитию различных заболеваний.

Данные особенностей распределения специфичностей генов HLA II класса, ассоциированных с аутоиммунными заболеваниями, могут быть использованы для прогнозирования характера распространенности этих заболеваний среди восточнославянских популяций

Полученные данные могут служить теоретической базой для практических рекомендаций по качественному и количественному составу регистров доноров аллогенного костного мозга в различных регионах нашей страны.

Популяционные данные могут быть использованы в судебно-медицинской практике для идентификации личности.

Полученные данные могут быть использованы в антропогенетических исследованиях для изучения истории формирования народов Евразии.

Данные могут быть использованы в учебном процессе при проведении лекций и практических курсов по иммунологии и медицинской генетике для студентов медико-биологических специальностей

 

 







ЧТО ТАКОЕ УВЕРЕННОЕ ПОВЕДЕНИЕ В МЕЖЛИЧНОСТНЫХ ОТНОШЕНИЯХ? Исторически существует три основных модели различий, существующих между...

Что делать, если нет взаимности? А теперь спустимся с небес на землю. Приземлились? Продолжаем разговор...

Конфликты в семейной жизни. Как это изменить? Редкий брак и взаимоотношения существуют без конфликтов и напряженности. Через это проходят все...

Живите по правилу: МАЛО ЛИ ЧТО НА СВЕТЕ СУЩЕСТВУЕТ? Я неслучайно подчеркиваю, что место в голове ограничено, а информации вокруг много, и что ваше право...





Не нашли то, что искали? Воспользуйтесь поиском гугл на сайте:


©2015- 2022 zdamsam.ru Размещенные материалы защищены законодательством РФ.